Filogeografía de glmM en cepas de Helicobacter pylori aisladas de pacientes con patologías gástricas al sur de México

Autores/as

  • Alan Michelle Ferman-Orduña Laboratorio de Microbiología Molecular y Biotecnología Ambiental, Universidad Autónoma de Guerrero, Chilpancingo, Guerrero. México.
  • Rogelio Gabriel Torres-Ramos Laboratorio de Microbiología Molecular y Biotecnología Ambiental, Universidad Autónoma de Guerrero, Chilpancingo, Guerrero. México.
  • Adolfo Román-Román Laboratorio de Microbiología Molecular y Biotecnología Ambiental, Universidad Autónoma de Guerrero, Chilpancingo, Guerrero. México.
  • Angela Victoria Forero-Forero Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México, Ciudad Universitaria, México.
  • Jesús Carlos Ruvalcaba Ledezma Departamento de Medicina y Coordinación de la Maestría en Salud Pública en [ICSa-UAEH] Instituto de Ciencias de la Salud-Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo, Pachuca hidalgo, México.
  • Jeiry Toribio-Jiménez Laboratorio de Microbiología Molecular y Biotecnología Ambiental, Universidad Autónoma de Guerrero, Chilpancingo, Guerrero. México.

DOI:

https://doi.org/10.19230/jonnpr.3769

Palabras clave:

Helicobacter pylori, variabilidad genética, gen glmM, filogeografía

Resumen

Introducción. Helicobacter pylori posee un genoma de aproximadamente 1600 genes, el gen glmM está  altamente conservado y se ha utilizado para identificar H. pylori por su sensibilidad y especificidad en  biopsias gástricas. La diversidad genética de H. pylori es alta entre cepas del mismo origen geográfico y es  aún más a escala global. En México, son pocos los estudios que destacan la importancia de la variabilidad  genética de esta bacteria, la cual es estudiada mediante técnicas moleculares.

Objetivo. Analizar la variabilidad genética del gen glmM en cepas de H pylori de pacientes con patologías  gástricas.

Metodología. Se analizaron solo 90 secuencias del gen glmM (10 de grupo de estudio y 80 depositadas en el  GenBank), posteriormente realizamos redes de haplotipos, donde se puede observar las diferencias en pasos utacionales de las secuencias a nivel estatal y con otros grupos geográficos con el fin de hacer una  reconstrucción de filogenia basada en las relaciones ancestro-descendiente.

Resultados. Las cepas analizadas provenían el 30% hombres y 70% mujeres, con una edad promedio de 42  años, con diagnóstico de gastritis, las secuencias de glmM mostraron variabilidad genética. De las secuencias analizadas, se propone confirmar la presencia de ocho haplotipos que se agrupan separados.

Conclusiones: Se sugiere hacer estudios detallados a nivel molecular de los haplotipos del gen glmM en  cepas de H. pylori para conocer su distribución geográfica con la finalidad de conocer las cepas circulantes a  nivel mundial y con esto evitar los resultados negativos.

 

Descargas

Los datos de descargas todavía no están disponibles.

Citas

Hunt, R.H., Xiao, S.D., Megraud, F., Leon-Barua, R., Bazzoli, F., van der Merwe., et al. Helicobacter pylori en los países en desarrollo. Guías prácticas de la Organización Mundial de Gastroenterología. 2010. 1: 3-10. https://www.worldgastroenterology.org/UserFiles/file/guidelines/helicobacter-pylori-spanish-2010.pdf

Mobley, H., Mendz, G., Hazell, S. Heterogenity and Subtyping. Helicobacter pylori: Physiology and Genetics. 2001. 3:15-20. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK2436/

Suzuki, R., Shiota, S., Yamaoka, Y. Molecular epidemiology, population genetics, and pathogenic role of Helicobacter pylori. Infection, Genetics and Evolution. 2002. 12:203-13. doi: 10.1016/j.meegid.2011.12.002.

Espinoza, M. G., Vazquez, R. G., Mendez, I. M., Vargas, C. R., & Cerezo, S. G. Detection of the glmM gene in Helicobacter pylori isolates with a novel primer by PCR. Journal of Clinical Microbiology. 2011. 49(4), 1650–2. doi:10.1128/JCM.00461-10

Tamer, E., Wail, H., Israr, S., Walid, S., Mohammad, F. Determination of Helicobacter pylori Virulence Genes in Gastric Biopsies by PCR. ISRN Gastroenterology. 2003. 13:4. doi: 10.1155/2013/606258

Dorer, M. S., Fero, J., Salama, N. R., (2010) DNA damage triggers genetic exchange in Helicobacter pylori. PLoS Pathogens. 6: 1–10. doi: 10.1371/journal.ppat.1001026

Goosen C, Theron J, Ntsala M, Maree FF, Olckers A, Botha SJ, Lastovica AJ, van der Merwe SW. Evaluation of a novel heminested PCR assay based on the phosphoglucosamine mutase gene for detection of Helicobacter pylori in saliva and dental plaque. J Clin Microbiol. 2002 Jan;40(1):205-9. doi: 10.1128/jcm.40.1.205-209.2002. PubMed PMID: 11773117; PubMed Central PMCID: PMC120087.

Florez Rueda Ana Marcela. Estructura poblacional y filogeografia de Curcubita moschata. Tesis de Maestría, Universidad Nacional de Colombia. 2009. http://bdigital.unal.edu.co/1873/

Avise, J.C. Phylogeography: the history and formation of species. Cambridge, Massachusetts Harvard University, Massachusetts, 1999. 417 pp. DOI: 10.1093/icb/41.1.134

Gressmann, H., Linz, B., Ghai, R., Pleissner, K.P., Schlapbach, R., Yamaoka, Y., Kraft, C., et al. Gain and Loss of Multiple Genes During the Evolution of Helicobacter pylori. PLoS Genet. 2005. 1: 424-6. DOI:10.1371/journal.pgen.0010043

Janssen, P.J., Audit, B., Ouzounis, C.A. Strain-specific genes of Helicobacter pylori: distribution, function and dynamics. Nucleic Acids Res. 2001. 1: 4395–404. DOI: 10.1093/nar/29.21.4395

Dong, Q.J., Wang, Q., Xin, Y.N., Li, N., Xuan, S.Y. Comparative genomics of Helicobacter pylori. World J Gastroenterol. 2009. 15: 3984-91. doi: 10.3748/wjg.15.3984

Odenbreit, S., Swoboda, K., Barwig, I., Ruhl, S., Borén, T., Koletzko, S. Outer Membrane Protein Expression Profile in Helicobacter pylori Clinical Isolates. Infect Immun. 2009. 77: 3782–90. doi: 10.1128/IAI.00364-09.

Publicado

2020-10-14